Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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