Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Rdh10Q8VCH7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh10Q8VCH7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh10Q8VCH7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh10Q8VCH7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh10Q8VCH7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh10Q8VCH7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh10Q8VCH7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh10Q8VCH7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh10Q8VCH7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Rdh10Q8VCH7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh10Q8VCH7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Rdh10Q8VCH7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Rdh10Q8VCH7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh10Q8VCH7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh10Q8VCH7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Rdh10Q8VCH7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh10Q8VCH7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh10Q8VCH7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh10Q8VCH7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh10Q8VCH7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh10Q8VCH7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Rdh10Q8VCH7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh10Q8VCH7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Rdh10Q8VCH7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Rdh10Q8VCH7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh10Q8VCH7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Rdh10Q8VCH7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh10Q8VCH7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Rdh10Q8VCH7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh10Q8VCH7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh10Q8VCH7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh10Q8VCH7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Rdh10Q8VCH7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Rdh10Q8VCH7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh10Q8VCH7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh10Q8VCH7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh10Q8VCH7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh10Q8VCH7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh10Q8VCH7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh10Q8VCH7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh10Q8VCH7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh10Q8VCH7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdh10Q8VCH7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdh10Q8VCH7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdh10Q8VCH7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdh10Q8VCH7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdh10Q8VCH7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdh10Q8VCH7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdh10Q8VCH7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdh10Q8VCH7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdh10Q8VCH7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdh10Q8VCH7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdh10Q8VCH7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms