Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4B8

Nlrp3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp3Q8R4B8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nlrp3Q8R4B8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrp3Q8R4B8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrp3Q8R4B8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrp3Q8R4B8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrp3Q8R4B8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrp3Q8R4B8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrp3Q8R4B8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp3Q8R4B8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp3Q8R4B8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp3Q8R4B8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp3Q8R4B8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp3Q8R4B8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp3Q8R4B8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp3Q8R4B8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp3Q8R4B8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp3Q8R4B8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp3Q8R4B8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp3Q8R4B8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp3Q8R4B8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp3Q8R4B8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp3Q8R4B8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp3Q8R4B8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp3Q8R4B8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp3Q8R4B8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp3Q8R4B8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp3Q8R4B8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp3Q8R4B8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp3Q8R4B8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp3Q8R4B8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp3Q8R4B8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp3Q8R4B8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp3Q8R4B8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp3Q8R4B8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp3Q8R4B8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp3Q8R4B8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp3Q8R4B8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp3Q8R4B8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp3Q8R4B8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp3Q8R4B8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp3Q8R4B8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp3Q8R4B8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp3Q8R4B8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms