Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Dnaaf4Q8R368 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnaaf4Q8R368 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms