Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
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Vmn1r200Q8R281 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r200Q8R281 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r200Q8R281 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r200Q8R281 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r200Q8R281 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r200Q8R281 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r200Q8R281 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r200Q8R281 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vmn1r200Q8R281 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vmn1r200Q8R281 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r200Q8R281 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r200Q8R281 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r200Q8R281 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r200Q8R281 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r200Q8R281 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r200Q8R281 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r200Q8R281 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Vmn1r200Q8R281 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r200Q8R281 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Vmn1r200Q8R281 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r200Q8R281 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Vmn1r200Q8R281 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r200Q8R281 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Vmn1r200Q8R281 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Vmn1r200Q8R281 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Vmn1r200Q8R281 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Vmn1r200Q8R281 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Vmn1r200Q8R281 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Vmn1r200Q8R281 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Vmn1r200Q8R281 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r200Q8R281 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r200Q8R281 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r200Q8R281 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r200Q8R281 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r200Q8R281 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r200Q8R281 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r200Q8R281 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r200Q8R281 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r200Q8R281 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r200Q8R281 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r200Q8R281 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r200Q8R281 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r200Q8R281 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r200Q8R281 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r200Q8R281 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r200Q8R281 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r200Q8R281 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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