Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b4Q8QZY9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms