Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc12Q8K5B8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms