Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Hecw1Q8K4P8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms