Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lin28aQ8K3Y3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lin28aQ8K3Y3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lin28aQ8K3Y3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lin28aQ8K3Y3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lin28aQ8K3Y3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lin28aQ8K3Y3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lin28aQ8K3Y3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lin28aQ8K3Y3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lin28aQ8K3Y3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lin28aQ8K3Y3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lin28aQ8K3Y3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lin28aQ8K3Y3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lin28aQ8K3Y3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lin28aQ8K3Y3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lin28aQ8K3Y3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin28aQ8K3Y3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin28aQ8K3Y3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin28aQ8K3Y3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin28aQ8K3Y3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin28aQ8K3Y3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin28aQ8K3Y3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin28aQ8K3Y3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin28aQ8K3Y3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin28aQ8K3Y3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin28aQ8K3Y3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin28aQ8K3Y3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin28aQ8K3Y3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin28aQ8K3Y3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin28aQ8K3Y3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lin28aQ8K3Y3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lin28aQ8K3Y3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lin28aQ8K3Y3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lin28aQ8K3Y3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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