Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdh16f2Q8K3M1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms