Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
OptnQ8K3K8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms