Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vrk3Q8K3G5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vrk3Q8K3G5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vrk3Q8K3G5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vrk3Q8K3G5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vrk3Q8K3G5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vrk3Q8K3G5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vrk3Q8K3G5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vrk3Q8K3G5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vrk3Q8K3G5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vrk3Q8K3G5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vrk3Q8K3G5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vrk3Q8K3G5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vrk3Q8K3G5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vrk3Q8K3G5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vrk3Q8K3G5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vrk3Q8K3G5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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