Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W6

Phf13, PHD finger protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf13Q8K2W6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Phf13Q8K2W6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Phf13Q8K2W6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Phf13Q8K2W6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Phf13Q8K2W6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf13Q8K2W6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Phf13Q8K2W6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Phf13Q8K2W6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Phf13Q8K2W6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Phf13Q8K2W6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf13Q8K2W6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf13Q8K2W6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf13Q8K2W6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf13Q8K2W6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf13Q8K2W6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms