Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Paf1Q8K2T8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Paf1Q8K2T8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Paf1Q8K2T8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Paf1Q8K2T8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Paf1Q8K2T8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Paf1Q8K2T8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Paf1Q8K2T8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Paf1Q8K2T8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Paf1Q8K2T8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Paf1Q8K2T8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Paf1Q8K2T8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Paf1Q8K2T8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Paf1Q8K2T8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Paf1Q8K2T8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Paf1Q8K2T8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Paf1Q8K2T8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Paf1Q8K2T8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Paf1Q8K2T8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Paf1Q8K2T8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Paf1Q8K2T8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms