Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Depp1Q8K2F3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms