Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd3Q8K2C9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacd3Q8K2C9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacd3Q8K2C9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacd3Q8K2C9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacd3Q8K2C9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacd3Q8K2C9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacd3Q8K2C9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacd3Q8K2C9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacd3Q8K2C9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacd3Q8K2C9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacd3Q8K2C9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacd3Q8K2C9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacd3Q8K2C9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms