Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scara5Q8K299 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Scara5Q8K299 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Scara5Q8K299 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Scara5Q8K299 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scara5Q8K299 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scara5Q8K299 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scara5Q8K299 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scara5Q8K299 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Scara5Q8K299 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scara5Q8K299 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scara5Q8K299 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scara5Q8K299 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Scara5Q8K299 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scara5Q8K299 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scara5Q8K299 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scara5Q8K299 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Scara5Q8K299 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scara5Q8K299 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scara5Q8K299 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scara5Q8K299 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scara5Q8K299 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scara5Q8K299 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scara5Q8K299 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scara5Q8K299 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scara5Q8K299 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scara5Q8K299 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scara5Q8K299 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scara5Q8K299 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scara5Q8K299 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scara5Q8K299 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Scara5Q8K299 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scara5Q8K299 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scara5Q8K299 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Scara5Q8K299 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Scara5Q8K299 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scara5Q8K299 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scara5Q8K299 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scara5Q8K299 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scara5Q8K299 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scara5Q8K299 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms