Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Mtmr3Q8K296 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Mtmr3Q8K296 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Mtmr3Q8K296 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Mtmr3Q8K296 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Mtmr3Q8K296 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Mtmr3Q8K296 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Mtmr3Q8K296 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Mtmr3Q8K296 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Mtmr3Q8K296 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Mtmr3Q8K296 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Mtmr3Q8K296 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Mtmr3Q8K296 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Mtmr3Q8K296 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mtmr3Q8K296 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms