Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nek9Q8K1R7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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