Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms