Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHQ0

Fbxo4, F-box only protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo4Q8CHQ0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fbxo4Q8CHQ0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo4Q8CHQ0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo4Q8CHQ0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo4Q8CHQ0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo4Q8CHQ0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo4Q8CHQ0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo4Q8CHQ0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo4Q8CHQ0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms