Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Lrrc9Q8CDN9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lrrc9Q8CDN9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms