Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lancl3Q8CD19 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms