Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCM6

Timm21, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim21, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm21Q8CCM6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timm21Q8CCM6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Timm21Q8CCM6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Timm21Q8CCM6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timm21Q8CCM6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Timm21Q8CCM6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timm21Q8CCM6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timm21Q8CCM6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timm21Q8CCM6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timm21Q8CCM6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timm21Q8CCM6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Timm21Q8CCM6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timm21Q8CCM6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timm21Q8CCM6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timm21Q8CCM6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timm21Q8CCM6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timm21Q8CCM6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timm21Q8CCM6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Timm21Q8CCM6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timm21Q8CCM6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Timm21Q8CCM6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timm21Q8CCM6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timm21Q8CCM6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timm21Q8CCM6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timm21Q8CCM6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timm21Q8CCM6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timm21Q8CCM6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Timm21Q8CCM6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timm21Q8CCM6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Timm21Q8CCM6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timm21Q8CCM6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Timm21Q8CCM6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timm21Q8CCM6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Timm21Q8CCM6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timm21Q8CCM6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timm21Q8CCM6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Timm21Q8CCM6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Timm21Q8CCM6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms