Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms