Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4J0

Ccdc60, Coiled-coil domain-containing protein 60, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc60Q8C4J0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc60Q8C4J0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc60Q8C4J0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc60Q8C4J0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc60Q8C4J0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc60Q8C4J0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc60Q8C4J0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc60Q8C4J0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc60Q8C4J0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc60Q8C4J0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc60Q8C4J0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc60Q8C4J0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc60Q8C4J0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms