Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3W1

Uncharacterized protein C1orf198 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C3W1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q8C3W1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q8C3W1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q8C3W1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q8C3W1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q8C3W1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q8C3W1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q8C3W1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q8C3W1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q8C3W1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q8C3W1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q8C3W1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q8C3W1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Q8C3W1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q8C3W1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q8C3W1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q8C3W1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q8C3W1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Q8C3W1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q8C3W1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q8C3W1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q8C3W1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Q8C3W1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q8C3W1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8C3W1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8C3W1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q8C3W1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms