Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK4

Rdh12, Retinol dehydrogenase 12, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh12Q8BYK4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rdh12Q8BYK4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rdh12Q8BYK4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rdh12Q8BYK4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rdh12Q8BYK4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rdh12Q8BYK4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rdh12Q8BYK4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rdh12Q8BYK4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rdh12Q8BYK4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rdh12Q8BYK4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rdh12Q8BYK4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rdh12Q8BYK4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rdh12Q8BYK4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rdh12Q8BYK4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms