Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYI9

Tnr, Tenascin-R, mousemouse

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnrQ8BYI9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TnrQ8BYI9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TnrQ8BYI9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms