Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Slx1bQ8BX32 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slx1bQ8BX32 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms