Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ube3dQ8BX13 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ube3dQ8BX13 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ube3dQ8BX13 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ube3dQ8BX13 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ube3dQ8BX13 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ube3dQ8BX13 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ube3dQ8BX13 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ube3dQ8BX13 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ube3dQ8BX13 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3dQ8BX13 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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