Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms