Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Ctdsp2Q8BX07 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
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Ctdsp2Q8BX07 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Ctdsp2Q8BX07 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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