Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms