Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU27

Ppm1m, Protein phosphatase 1M, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppm1mQ8BU27 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppm1mQ8BU27 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms