Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU7

Rccd1, RCC1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rccd1Q8BTU7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rccd1Q8BTU7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rccd1Q8BTU7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms