Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH32

Susd4, Sushi domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd4Q8BH32 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Susd4Q8BH32 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms