Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg4dQ8BGV9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4dQ8BGV9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms