Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q8BGC1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q8BGC1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Q8BGC1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8BGC1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8BGC1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8BGC1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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