Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Htatsf1Q8BGC0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms