Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Katnb1Q8BG40 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Katnb1Q8BG40 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms