Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms