Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms