Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc50Q810U5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms