Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Liat1Q810M6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Liat1Q810M6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Liat1Q810M6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Liat1Q810M6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Liat1Q810M6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Liat1Q810M6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Liat1Q810M6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Liat1Q810M6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms