Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc27Q80YS5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc27Q80YS5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc27Q80YS5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc27Q80YS5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc27Q80YS5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc27Q80YS5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc27Q80YS5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc27Q80YS5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc27Q80YS5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc27Q80YS5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc27Q80YS5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc27Q80YS5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc27Q80YS5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc27Q80YS5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc27Q80YS5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc27Q80YS5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc27Q80YS5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc27Q80YS5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc27Q80YS5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc27Q80YS5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc27Q80YS5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc27Q80YS5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc27Q80YS5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc27Q80YS5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc27Q80YS5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrrc27Q80YS5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrrc27Q80YS5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrrc27Q80YS5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrrc27Q80YS5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrrc27Q80YS5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrrc27Q80YS5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrrc27Q80YS5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrrc27Q80YS5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrrc27Q80YS5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Lrrc27Q80YS5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc27Q80YS5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms