Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Avl9Q80U56 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms