Protein–RNA interactions for Protein: Q80U22

Rusc2, Iporin, mousemouse

Predictions only

Length 1,514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rusc2Q80U22 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rusc2Q80U22 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rusc2Q80U22 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms