Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pja2Q80U04 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pja2Q80U04 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pja2Q80U04 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms