Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC37.85■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC37.84■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC37.82■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
NischQ80TM9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
NischQ80TM9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
NischQ80TM9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
NischQ80TM9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
NischQ80TM9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
NischQ80TM9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
NischQ80TM9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
NischQ80TM9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
NischQ80TM9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
NischQ80TM9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
NischQ80TM9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
NischQ80TM9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NischQ80TM9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NischQ80TM9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NischQ80TM9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NischQ80TM9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NischQ80TM9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NischQ80TM9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NischQ80TM9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NischQ80TM9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NischQ80TM9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC37.8■■■■□ 3.64
NischQ80TM9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
NischQ80TM9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NischQ80TM9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
NischQ80TM9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NischQ80TM9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NischQ80TM9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NischQ80TM9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
NischQ80TM9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
NischQ80TM9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
NischQ80TM9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
NischQ80TM9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
NischQ80TM9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
NischQ80TM9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
NischQ80TM9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
NischQ80TM9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
NischQ80TM9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
NischQ80TM9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
NischQ80TM9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
NischQ80TM9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
NischQ80TM9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
NischQ80TM9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
NischQ80TM9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
NischQ80TM9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
NischQ80TM9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
NischQ80TM9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
NischQ80TM9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
NischQ80TM9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
NischQ80TM9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
NischQ80TM9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NischQ80TM9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
NischQ80TM9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
NischQ80TM9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NischQ80TM9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms